选择优质、健康的苗种是大棚养殖商品参成败的第一环，一般说来优质的苗种具有生长速度快、抗逆性强、成活率高等优点。正确的选择苗种一般有水中观察、盆中观察、了解苗种繁育史以及苗种化验等方法。
1、水中观察。优质参苗的一般有以下特征：体表干净完整、无损伤、无过多粘液、肉刺完整坚挺、体表光泽、摄食旺盛、粪便呈散落不粘连的粗长条状；参苗伸展度很好、管足附着力强、体色不发黑、活力强，对外界刺激反映强烈，触碰时参苗反应灵敏、收缩快。
2、盆中观察。随机挑取海参框，将参苗卡入白色塑料盆中，倒入少量池水，观察参苗在水盆中的附着速度、稳固性、附着数量，进一步观察参苗体表、体色、伸缩度并用手电观察参苗肠道是否粗壮完整。
如果发现参苗体色暗浊而黏滑或大量发黑，肉刺短而秃，甚至局部溃烂；体壁软薄无韧性，伸缩能力差，蜷缩僵硬，活力弱，管足附着无力；粪便细而粘连、膜状物增多等现象，则说明参苗不健康，不易购买。
3、了解苗种繁育史。近年来，海参苗种繁育场杂乱无章，不得不说，有一部分养殖者缺乏正规的育苗知识或人为的滥用药物，造成参苗质量千差万别。因此，购买苗种前一定要了解育苗场繁育史，对亲参或海参卵的来源、发病史、用药情况、技术实力和声誉等进行考察。特别是着重关注大规格苗种的养殖时间、养殖水体的盐度以及养殖水体是天然水还是地下水，使得大苗更换环境后能够更好的适用和更快的生长。
4、苗种化验。技术条件允许的情况下，可以利用显微镜对参苗体内外组织器官进行显微镜观察，初步分析是否存在寄生虫、细菌或组织病灶等，也可按照技术要求对养殖场的苗种进行采集，送至相关部门进行病原检测，确保购买的苗种不携带病原微生物，水中无桡足类、纤毛虫等有害生物。
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